สมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ เปิดรับสมัครสโมสรเข้าร่วมการแข่งขันฟุตบอล เอฟเอ คัพ 2016 ซึ่งการรับสมัครวันสุดท้ายคือวันที่ 19 เมษายน แต่ไม่เกิน 12.00 น. ส่วนเอกสารการสมัคร ประกอบด้วย ใบสมัครเข้าร่วมการแข่งขันฟุตบอล เอฟเอ คัพ 2016, แบบฟอร์มรายชื่อนักกีฬาและเจ้าหน้าที่, แผนผังรูปนักกีฬาและเจ้าหน้าที่, เงินประกันทีม จำนวน 20,000 บาท ส่งมาที่บริษัท พรีเมียร์ลีก (ไทยแลนด์) จำกัด เลขที่ 942/52 อาคารชาญอิสระ 1 ชั้น 2 ถนนพระราม 4 แขวงสุริยวงศ์ เขตบางรัก กรุงเทพฯ 10500 และจะมีการจับสลาก ในวันที่ 22 เมษายน ที่ห้องประชุมสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทย สนามกีฬาศุภชลาศัย เวลา 13.00 น. โดยคุณสมบัติสโมสรที่จะสมัครเข้าร่วมการแข่งขัน จะต้องเป็นสมาชิกสมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทย และผ่านหลักเกณฑ์ที่สมาคมกีฬาฟุตบอลฯ กำหนด โดยทีมแชมป์รายการนี้ นอกจากจะได้เงินรางวัลแล้ว ยังได้สิทธิ์ไปเล่นฟุตบอล เอเอฟซี แชมเปี้ยนส์ลีก รอบเพลย์ออฟ โดยอัตโนมัติอีกด้วย สำหรับการแข่งขันฟุตบอล เอฟเอ คัพ เริ่มขึ้นมาตั้งแต่ปี 1965 จนถึงปัจจุบัน สโมสรที่คว้าแชมป์รายการนี้ไปครองมากที่สุดที่ 5 สมัย ก็คือ สโมสรกีฬาราชประชา
